Problem gelöst!
Ich habe festgestellt, dass nach der Neuinstallation von Kodi das TheTVDB- Scraper- Addon nicht installiert war.
Somit wurden alle Suchen mit TMDB gemacht- deshalb die Probleme mit den Serien mit gesonderten Staffelbezeichnungen.
Nach Installation und Aktivierung von TheTVDB für die Serien funktionierte alles einwandfrei.
Vielen Dank an Alle!