Mir ist aufgefallen, dass die Datenbank Bereinigung nicht mehr so ganz funktioniert.
Ich hatte 3 komplette Serien gelöscht und die Verzeichnisse sind nicht mehr vorhanden. Eine Säuberung der Datenbank über Tools oder Strg + Alt + D hat die Serien nicht aus Ember gelöscht.
Im Logfile steht, dass das Cleaning für Movies und Moviesets jeweils gestartet und beendet wurde. Serien werden jedoch nicht beendet. Ich hab dann die drei betroffenen Serien manuell entfernt. Das hat geklappt.