Also, ich habe jetzt folgendes gemacht.
Zunächst habe ich die Serien-Bibliothek geleert, also jeden Eintrag entfernt und die Bibliothek noch bereinigt (kA, ob das alles notwendig war). Dann habe ich zunächst den Ordner "Sehen" gelöscht, nachdem ich die Unterordner "Filme", "Serien" und "Dokus" eine Ebene hochgeschoben habe. Alle Ordner mit Medien (=Quellen für Kodi) liegen jetzt also direkt unter ...\Mediaplatte I\<Ordnername>.
Ich habe dann alle Serien nach dem Muster "Serienname.S0xEy.ext" benannt. Nach einem Neustart des Raspi, weil Debugging aktiviert und für ein frisches Log-File, habe ich die Quelle "...\Mediaplatte I\Serien" zur Bibliothek hinzugefügt. Der Scraper (thetvdb.com) ist exakt so eingestellt, wie vorher.
... und siehe da, es hat geklappt. Entweder die Ebenen der Ordnerstruktur haben Kodi überfordert oder es hat geholfen, die Episodentitel wegzulassen. Jedenfalls passt jetzt alles.
Vielen Dank an euch.