Also ich hab jetzt denk ich mal zumindest die Ursache für das Problem herausgefunden. Die besagten Anzeigefehler scheinen nicht aufzutauchen wenn man Kodi zum ersten mal startet und sofort ein Video startet.
Wenn Kodi aber irgendwann den Screensaver bei Nichtnutzung an macht, man mit Alt+TAB zwischendurch mal zum Desktop wechselt oder den NUC mit laufenden Kodi in den Standby Modus schickt sind die Fehler da.
Aber gerade das mit dem Standby nutze ich eigentlich recht gern und das war auch früher nie ein Problem.