Bei einem HDD Ausfall in deinem JBOD (Just a Bunch of Disks) Verbund verlierst du alle Daten. Da die Festplatten theoretisch wild verstreut auf allen HDDs liegen.
Zu deiner ersten Frage:
In Anbetracht dessen, dass du einen JBOD Verbund nutzt, würde ich eine weitere 4TB Platte kaufen. Dann alle Daten extern sichern und mir dann ein RAID aufbauen.
Mit Server 2012 Essential hast du die Möglichkeit ein Software RAID mit den integrierten Speicherpools aufzubauen. So habe ich es bei meinem MicroServer gemacht.
1x SSD für Windows Server
1x HDD 1 TB für "Bewegungsdaten"
4x HDD 4TB im "Raid5" Speicherpool
So kann mir eine der 4 TB Festplatten ausfallen, ohne das ich Daten verliere