Ok, es funktioniert jetzt.
Warum weiß ich allerdings nicht so genau.
Ich schätze, da war irgendeine Treiberkonfiguration nicht ganz korrekt.
Ich hatte verschiedene USB Anschlüsse auf dem board ausprobiert und auch zwischenzeitlich mal den Empfänger im Gerätemanager deinstalliert / neu installiert.
Mir ist danach aufgefallen, dass z.B. beim Drücken nach rechts auf der FB zwei Befehle gesendet wurden (wohl von Eventghost und Windows HID), das war vorher nicht.
Habe dann Eventghost in der aktuellen Version neu installiert und auch das Plugin "Microsoft MCE Remote - Vista/Win7" inkl. "AlternateMceIrService" neu eingerichtet.
Nun geht sowohl das Aufwecken über WOL als auch über die FB aus S3/S4/S5. Problem gelöst, danke schön...
MfG Topper