Die Frage ist sicherlich an alle gerichtet. Ich weiß es nicht. Eine Idee kam mir durch den Kopf - normalerweise wirst du mit den Dateien nicht so viel rumspielen (wie du davon machen etc.). Dabei werden sich access-Time Zeitstempel ändern, vielleicht mehr in der internen Struktur des FS. Von rsync erwarte ich, dass es nicht nur Größe, sondern auch Zeitstempel berücksichtigt. Wenn ein Byte in einem GB geändert wird, muss das ja trotzdem konsistent sein. Allerdings würde ich jetzt bei den hier diskutierten Befehlen immer nur Read/Access Stempel geändert erwarten - und da würde ich erwarten, dass rsync das versteht.
Sind die Shares noch freigegeben? Ich würde jetzt (in privatem Umfeld, wo ich praktisch alleine werkle) für die ganzen Aktionen die ganzen Sharing-Services in OMV abschalten. Sonst kann daher auch noch "Rauschen" kommen.