Hi,
ich nutze grundsätzlich Avidemux, gerade auch beim Zusammenschneiden.
Du kannst Framegenau, ohne Verluste schneiden. Dabei ist es wichtig, sofern nicht alle Schnittpunkte auf i-Frames liegen, das du die Datei neu konvertierst (zB x264 od. h265 - Qualität lässt sich unter Einstellung dann noch verfeinern). Damit werden dann Bildfehler vermieden, jedenfalls hatte ich noch keine, sofern das Ursprungsmaterial sauber ist und Avidemux die Datei einlesen kann).
Als Alternative könnte man auch 2 NFO Dateien erstellen, mit jeweils den gleichen Infos. Titel und Titelsortierung entsprechen mit Teil 1, Teil 2 usw. hinterlegen. Bei Kodi wird das sauber getrennt + angezeigt und gefunden (Plex ist da dann eine andere Sache, sofern das in Frage kommen sollte).
Gruß
Quork