Alle Serien plötzlich als 'gesehen' markiert

Leider Pech gehabt.
Da wirst du nicht mehr an den alten Status gelangen, es sei denn, du hast den zwischenzeitlich mal exportiert.
Das ist ein unschöner Datenbankfehler.

Das passiert äußerst selten bei sehr sehr wenigen Usern.
Den meisten passiert das also nie.
Du kannst hin und wieder deine Datenbank sichern um einen Ankerpunkt zu haben, auf den zu zurückgreifen kannst.

Grundsätzlich wäre nun aber mal deine Kodi Installation/Hardware zu prüfen.
Solche Fehler treten ja selten grundlos auf. Daher wäre eigentlich meine Empfehlung "beginne von 0" und schaffe dir eine saubere Umgebung zum starten.