Ohhh, Dankeschön für diesen wirklich hilfreichen Tipp!
Wenn ich mit einer weiteren Unterordner-Ebene arbeite, dann klappt's deutlich besser.
Das eigentliche Problem scheint sich zwar nur eine Stufe nach unten zu verschieben, denn nach einem Neustart werden in diesen neuen Staffel-Unterordnern hinzugekommene Dateien zwar noch immer nicht gefunden, aber:
Mit dieser Ordnerstruktur reicht jetzt ein einziges "Neue Inhalte suchen" auf dem Hauptordner und alle neuen Folgen aller Serien werden erkannt und in die DB übernommen. Und das ist in der Tat eine riesen Erleichterung.
Also, Danke nochmal!